中药学院实验室由三部分组成，主体位于C楼北侧，共5个楼层，每层4个实验室；另两部分分别为中药资源研发工程中心及中药加工实训平台。围绕产业发展需求和学科发展前沿，为中药学、中药资源与开发以及中草药栽培与鉴定3个本科专业的提供教科研的实验、实习、实训场所，培养了学生实践能力和实际操作技能。实验室功能全面，各项管理制度健全，管理规范。安装了现代化的通风、应急保护、消防设施，为学生创造一个良好的实验条件和科研氛围。实验室面积2000余平方米，实验仪器类固定资产3000余万元，专兼职实验教师6人，高级职称2人，中级职称2人，其他2人。实验教师业务能力突出，实践动手能力强。为所有实验项目的顺利开展提供了专业技术保障。
实验室现有药用植物、中药化学、中药分析、中药加工、中药制剂、中药产品开发、中药药理、中药鉴定、微生物等相关实验室22个。整体实验室还支撑省教育厅的两个科研平台，分别为吉林省道地药材生产利用技术创新重点实验室、人参高端科技创新平台。实验室现有气相色谱质谱联用仪、制备高效液相色谱仪、高效液相色谱仪、ICP发射光谱仪、微生物鉴定系统、酶标仪、荧光定量PCR、逆流色谱、脂肪检测仪、SO2检测仪、高速冷冻离心机、超低温冰箱、软胶囊生产线、滴丸机、口服液灌装机、冷冻干燥器、纯水机、喷雾干燥机、多功能药物测定仪等实验仪器3000余台套。为教师的科研与学生的创新及科研训练提供了平台保障。
为提高教师科研水平，促进教学工作，同时培养学生创新创业意识，实验室实施全部开放制度，满足教师科研需要，鼓励广大学生开展创新研究，参与教师科研项目，培养创新思维，有效推进学风建设。根据学生的专业、爱好，结合专业协会，在教师指导下，有序开展中药功效物质提取、中药成分质量分析检测、化学成分功效评价、健康产品开发、中草药与药用菌栽培、中药鉴定、中药功效识别及审方调剂等方向研究与实践。通过相关训练，提高了学生的实践技能，提高了科研能力，加强了学生的专业素养。
实验室积极发挥服务社会职能，实现资源共享，先后与吉林国安药业、吉林省参王植保有限公司、延边大阳参业有限公司、吉林省善生堂药业有限公司、吉林省天下一水食品有限公司、吉林金梓源生物科技有限公司等建立科研合作关系，为合作企业提供产品研发技术路线、中药材质量分析检测等服务。
